SegPore: RNA Modifikasiyalarının Daha Dəqiq Aşkarı

Finlandiya və Aalto Universitetlərinin tədqiqatçıları nanopore texnologiyasından istifadə edərək RNA modifikasiyalarını daha dəqiq aşkar etməyə imkan verən SegPore adlı yeni hesablama çərçivəsi hazırlayıblar. Bu alət, gen ifadəsinin epigenetik tənzimlənməsində və xəstəliklərin araşdırılmasında mühüm irəliləyişlərə səbəb ola bilər.

RNA Modifikasiyalarının Əhəmiyyəti

RNA modifikasiyaları gen ifadəsinin epigenetik tənzimlənməsində mühüm rol oynayır. Hüceyrə fərqlənməsi, stress reaksiyası və xəstəliklərin inkişafı kimi bioloji proseslərdə bu modifikasiyaların təsiri böyükdür. Nanopore texnologiyası RNA molekullarının tək-molekul səviyyəsində araşdırılmasına imkan verir. Lakin bu texnologiyanın xam siqnallarındakı yüksək səs-küy və struktur mürəkkəbliyi səbəbindən modifikasiyaların dəqiq aşkar olunması çətin idi.

SegPore Necə İşləyir?

SegPore, nanopore siqnalının yaranma prosesini daha dəqiq təsvir edən ağ qutu (white-box) modelindən istifadə edir. Alimlər motor proteinin RNA molekulunu yalnız irəli istiqamətdə deyil, həm də geri istiqamətdə hərəkət etdirdiyini aşkar ediblər. Bu hərəkət prosesində yaranan kiçik qeyri-müntəzəm dəyişikliklər elektrik siqnallarında əks olunur. SegPore bu dinamik prosesi modelləşdirərək, mövcud metodlardan daha yüksək dəqiqliklə RNA modifikasiyalarını aşkar edir.

Alimlərin Baxışı

'Nanopore siqnallarını dərindən araşdıraraq, motor proteinin RNA molekulunu həm irəli, həm də geri istiqamətdə hərəkət etdirdiyini kəşf etdik. Bu dinamik prosesi modelləşdirərək, mövcud metodlardan üstün olan şəffaf bir model hazırladıq,' deyə Finlandiya Biotibb İnstitutundan Akademiya Tədqiqatçısı Dr. Lu Çen bildirib.

İnsanlara Təsiri

SegPore aləti, RNA modifikasiyalarının daha dəqiq araşdırılmasına və onların sağlamlıq və xəstəliklərdəki funksional rolunun daha yaxşı başa düşülməsinə imkan yaradır. Bu, gələcəkdə xəstəliklərin diaqnostikası və müalicəsində mühüm irəliləyişlərə səbəb ola bilər.

Daha Çox Məlumat

SegPore haqqında daha ətraflı məlumat üçün eLife jurnalında dərc olunmuş araşdırmaya müraciət edə bilərsiniz. DOI: 10.7554/elife.104618.2.